秦末南越王赵佗的自立，是不是对大秦帝国的背叛呢？

他的自立门户不仅影响了秦国的发展，而且对秦国造成了比较大的打击，也确实可以被认定为是对秦国的背叛。

是的，在当时的情况下，他的这种做法确实构成了背叛，毕竟曾经秦始皇是非常信任对方的。