秦末南越王赵佗的自立，是不是对大秦帝国的背叛呢？

他的自立门户不仅影响了秦国的发展，而且对秦国造成了比较大的打击，也确实可以被认定为是对秦国的背叛。

不是的，这个时候秦国已经灭亡了，就不存在背叛的说法了。